MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 113947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015733	AGCA	2	8	159	166	50 %	0 %	25 %	25 %	339484942
2	NC_015733	TTG	2	6	220	225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484942
3	NC_015733	ACA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339484942
4	NC_015733	TTC	2	6	417	422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484942
5	NC_015733	CAGG	2	8	491	498	25 %	0 %	50 %	25 %	339484942
6	NC_015733	GCA	2	6	509	514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484942
7	NC_015733	CTG	2	6	582	587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484942
8	NC_015733	CAGGGC	2	12	597	608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339484942
9	NC_015733	ATGGCG	2	12	658	669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339484942
10	NC_015733	TCG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484942
11	NC_015733	CTG	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484942
12	NC_015733	GC	3	6	730	735	0 %	0 %	50 %	50 %	339484942
13	NC_015733	GCG	2	6	738	743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484942
14	NC_015733	GAT	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484942
15	NC_015733	ATCG	2	8	774	781	25 %	25 %	25 %	25 %	339484942
16	NC_015733	CAC	2	6	786	791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484942
17	NC_015733	TTCT	2	8	915	922	0 %	75 %	0 %	25 %	339484942
18	NC_015733	GC	3	6	950	955	0 %	0 %	50 %	50 %	339484942
19	NC_015733	GTT	2	6	1033	1038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484943
20	NC_015733	GGCCAG	2	12	1083	1094	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339484943
21	NC_015733	GC	3	6	1103	1108	0 %	0 %	50 %	50 %	339484943
22	NC_015733	GTT	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484943
23	NC_015733	GCA	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
24	NC_015733	GCG	2	6	1312	1317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484943
25	NC_015733	GAT	2	6	1383	1388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484943
26	NC_015733	GGC	2	6	1499	1504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484943
27	NC_015733	CAG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
28	NC_015733	CAC	2	6	1530	1535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484943
29	NC_015733	CGG	2	6	1538	1543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484943
30	NC_015733	GCA	2	6	1565	1570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
31	NC_015733	ACC	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484943
32	NC_015733	TGG	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484943
33	NC_015733	CAG	2	6	1713	1718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
34	NC_015733	ACG	2	6	1722	1727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
35	NC_015733	GGC	2	6	1746	1751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484943
36	NC_015733	GGT	3	9	1764	1772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484943
37	NC_015733	CAC	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484943
38	NC_015733	GCG	2	6	1848	1853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484944
39	NC_015733	CAG	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484944
40	NC_015733	TGC	2	6	2030	2035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484944
41	NC_015733	GAT	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484944
42	NC_015733	TCT	2	6	2156	2161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484944
43	NC_015733	CCAG	2	8	2249	2256	25 %	0 %	25 %	50 %	339484944
44	NC_015733	CGCT	2	8	2263	2270	0 %	25 %	25 %	50 %	339484944
45	NC_015733	TCG	2	6	2323	2328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484944
46	NC_015733	CGG	2	6	2339	2344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484944
47	NC_015733	AGC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484944
48	NC_015733	GC	3	6	2436	2441	0 %	0 %	50 %	50 %	339484944
49	NC_015733	T	6	6	2522	2527	0 %	100 %	0 %	0 %	339484945
50	NC_015733	CGC	2	6	2552	2557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484945
51	NC_015733	TCG	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
52	NC_015733	CAGG	2	8	2671	2678	25 %	0 %	50 %	25 %	339484945
53	NC_015733	CTG	2	6	2717	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
54	NC_015733	CAC	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
55	NC_015733	GC	3	6	2834	2839	0 %	0 %	50 %	50 %	339484945
56	NC_015733	CAG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484945
57	NC_015733	TGGCC	2	10	2896	2905	0 %	20 %	40 %	40 %	339484945
58	NC_015733	GCT	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
59	NC_015733	GGC	2	6	2984	2989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484945
60	NC_015733	TCG	2	6	3000	3005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
61	NC_015733	GTC	2	6	3131	3136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
62	NC_015733	TCG	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
63	NC_015733	GGC	2	6	3203	3208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484945
64	NC_015733	CTT	2	6	3241	3246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484945
65	NC_015733	GGT	2	6	3254	3259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484945
66	NC_015733	GAA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484945
67	NC_015733	CCG	2	6	3288	3293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484945
68	NC_015733	CG	3	6	3325	3330	0 %	0 %	50 %	50 %	339484945
69	NC_015733	AGT	2	6	3337	3342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484945
70	NC_015733	TG	3	6	3373	3378	0 %	50 %	50 %	0 %	339484945
71	NC_015733	GGAT	2	8	3394	3401	25 %	25 %	50 %	0 %	339484945
72	NC_015733	GGT	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484945
73	NC_015733	TGG	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484945
74	NC_015733	TCGA	2	8	3537	3544	25 %	25 %	25 %	25 %	339484945
75	NC_015733	GAT	2	6	3614	3619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484945
76	NC_015733	GC	3	6	3629	3634	0 %	0 %	50 %	50 %	339484945
77	NC_015733	CAG	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484945
78	NC_015733	TCA	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484945
79	NC_015733	CGG	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484945
80	NC_015733	GGC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484945
81	NC_015733	ACC	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
82	NC_015733	GGT	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484945
83	NC_015733	ACC	2	6	3924	3929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
84	NC_015733	GAA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484945
85	NC_015733	CAC	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
86	NC_015733	CGA	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484945
87	NC_015733	GTC	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
88	NC_015733	CTG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
89	NC_015733	CAC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
90	NC_015733	GTT	2	6	4121	4126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484945
91	NC_015733	GCC	2	6	4175	4180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484945
92	NC_015733	CAG	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484945
93	NC_015733	GCC	3	9	4334	4342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484945
94	NC_015733	GGGAA	2	10	4363	4372	40 %	0 %	60 %	0 %	339484945
95	NC_015733	CCA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
96	NC_015733	CAG	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
97	NC_015733	TCA	2	6	4992	4997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484946
98	NC_015733	CTG	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484946
99	NC_015733	CCAG	2	8	5073	5080	25 %	0 %	25 %	50 %	339484946
100	NC_015733	CTGGC	2	10	5115	5124	0 %	20 %	40 %	40 %	339484946
101	NC_015733	CCG	2	6	5167	5172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484946
102	NC_015733	GGT	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484946
103	NC_015733	GCA	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
104	NC_015733	CAC	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484946
105	NC_015733	CCA	3	9	5410	5418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484946
106	NC_015733	ACA	2	6	5419	5424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339484946
107	NC_015733	GTG	2	6	5568	5573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484946
108	NC_015733	CAG	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
109	NC_015733	GCA	2	6	5680	5685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
110	NC_015733	CGC	2	6	5801	5806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484946
111	NC_015733	GCGCA	2	10	5819	5828	20 %	0 %	40 %	40 %	339484946
112	NC_015733	GC	3	6	5894	5899	0 %	0 %	50 %	50 %	339484946
113	NC_015733	AGCC	2	8	6002	6009	25 %	0 %	25 %	50 %	339484946
114	NC_015733	CAAC	2	8	6012	6019	50 %	0 %	0 %	50 %	339484946
115	NC_015733	GCA	3	9	6034	6042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
116	NC_015733	ACC	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484946
117	NC_015733	CCA	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484946
118	NC_015733	TCG	2	6	6156	6161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484946
119	NC_015733	GGCC	2	8	6217	6224	0 %	0 %	50 %	50 %	339484946
120	NC_015733	GGC	2	6	6227	6232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484946
121	NC_015733	CCG	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484946
122	NC_015733	GGC	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484946
123	NC_015733	AGC	3	9	6411	6419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484947
124	NC_015733	T	6	6	6420	6425	0 %	100 %	0 %	0 %	339484947
125	NC_015733	GCTG	2	8	6426	6433	0 %	25 %	50 %	25 %	339484947
126	NC_015733	TGC	2	6	6440	6445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484947
127	NC_015733	CTG	2	6	6459	6464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484947
128	NC_015733	TG	3	6	6463	6468	0 %	50 %	50 %	0 %	339484947
129	NC_015733	GTT	2	6	6480	6485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484947
130	NC_015733	ACCAG	2	10	6502	6511	40 %	0 %	20 %	40 %	339484947
131	NC_015733	GAA	3	9	6525	6533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484947
132	NC_015733	GAT	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484947
133	NC_015733	CAT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484947
134	NC_015733	TCA	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484947
135	NC_015733	CGG	2	6	6582	6587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484947
136	NC_015733	GCT	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484947
137	NC_015733	TGG	2	6	6617	6622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484947
138	NC_015733	ATG	2	6	6628	6633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484947
139	NC_015733	GAA	2	6	6645	6650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484947
140	NC_015733	CAG	2	6	6717	6722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484947
141	NC_015733	GGCA	2	8	6766	6773	25 %	0 %	50 %	25 %	339484947
142	NC_015733	GCC	2	6	6774	6779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484947
143	NC_015733	TCT	2	6	6791	6796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484947
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145	NC_015733	TCT	2	6	6830	6835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484947
146	NC_015733	GC	3	6	6894	6899	0 %	0 %	50 %	50 %	339484947
147	NC_015733	GAA	2	6	6930	6935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484947
148	NC_015733	GAT	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484947
149	NC_015733	CAG	2	6	6987	6992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484947
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152	NC_015733	CAGT	2	8	7058	7065	25 %	25 %	25 %	25 %	339484947
153	NC_015733	GCC	2	6	7143	7148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484947
154	NC_015733	GCCGG	2	10	7165	7174	0 %	0 %	60 %	40 %	339484947
155	NC_015733	GAT	2	6	7182	7187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484947
156	NC_015733	GTT	2	6	7224	7229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484947
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159	NC_015733	TTTC	2	8	7301	7308	0 %	75 %	0 %	25 %	339484947
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162	NC_015733	TGAAGC	2	12	7526	7537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339484947
163	NC_015733	ACC	2	6	7579	7584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484947
164	NC_015733	GTT	2	6	7586	7591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484947
165	NC_015733	CTT	2	6	7617	7622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484947
166	NC_015733	GGT	2	6	7745	7750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484947
167	NC_015733	GAC	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484947
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169	NC_015733	CCGG	2	8	7933	7940	0 %	0 %	50 %	50 %	339484947
170	NC_015733	GCA	2	6	7975	7980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484947
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241	NC_015733	GC	3	6	12320	12325	0 %	0 %	50 %	50 %	339484952
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249	NC_015733	G	6	6	12591	12596	0 %	0 %	100 %	0 %	339484952
250	NC_015733	GCC	2	6	12704	12709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484952
251	NC_015733	CTA	2	6	12838	12843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484952
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254	NC_015733	CAG	2	6	12905	12910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484952
255	NC_015733	CAA	2	6	12967	12972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339484952
256	NC_015733	TGG	2	6	13008	13013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484952
257	NC_015733	CGC	2	6	13058	13063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484952
258	NC_015733	GAC	2	6	13106	13111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484952
259	NC_015733	CGC	2	6	13118	13123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484952
260	NC_015733	GC	3	6	13122	13127	0 %	0 %	50 %	50 %	339484952
261	NC_015733	GCTT	2	8	13134	13141	0 %	50 %	25 %	25 %	339484952
262	NC_015733	GAA	2	6	13142	13147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484952
263	NC_015733	TCA	2	6	13164	13169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484952
264	NC_015733	CTC	2	6	13307	13312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339484953
265	NC_015733	GAT	2	6	13380	13385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484953
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268	NC_015733	TCGA	2	8	13428	13435	25 %	25 %	25 %	25 %	339484953
269	NC_015733	TCA	2	6	13471	13476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484953
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283	NC_015733	TCG	2	6	13960	13965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484953
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293	NC_015733	CGT	2	6	14399	14404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484953
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384	NC_015733	CAAG	2	8	18838	18845	50 %	0 %	25 %	25 %	339484957
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386	NC_015733	TTC	2	6	18968	18973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484957
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